物种生态学又称遗传生态学，是指以单个物种为研究对象，以生态学、遗传学、生物化学、统计学、地学等学科为基础，主要从遗传和生态两个方面研究物种因环境差异而产生的种内变异和分化，从而揭示种群对环境的适应过程及其机理的一门新学科。

生物的生存和繁殖依赖于各种生态环境因子的综合作用，其中一种或少数几种生态因子是限制植物生存和繁殖的关键因子；生物生存所依赖的大、小环境决定了生物的定居範围。物种生态学理论主要包括：限制因子定律、耐性定律、生态因子综合定律、生态适应性定律、生态位定律。

从自然界中获取物质和能量构建自身是生物生长发育的必然过程，认识自然界生物可利用物质和能量的状态、性质、数量、时间和空间的变化，是生态学研究的基础。这些物质和能量及其对生物的影响就构成了物种生态学的研究内容。近代物种生态学的研究是生态学和生理学的交叉研究，侧重于研究个体从环境中获得资源和资源在机体生长和繁殖等方面的分配问题及其进化对策上的选择问题。

物种生态学的研究方法主要是鉴定动物和植物的分类技术，这也是研究生态学的基础。在进行物种鉴定时必须注意，要在儘量避免对研究对象的伤害或惊动的情况下，直接观察鉴定动植物的特徵。在野外条件下根据动物的外形、体色、活动、声音、行为、栖息地等特徵来鉴别动物种类的技术十分重要。

物种生态学的具体研究方法有：人们可以通过分析物种外部（环境）和内在（生理限制和种群机制）与空间变化的关联来理解生态学现象。生态过程依赖于地理尺度，因此生态过程需要环境异质性分析。在小尺度上，生物因素对于生态系统的影响较大，而在大尺度上，非生物因素，如气候控制着生态系统的功能。个体的反应也依赖于尺度，小尺度上为适应控制，即生物最大限度的提升其适合度适应栖息地，大尺度上为限制特徵控制，即生物对于环境条件的忍受来适应栖息地。